MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA02

Total Repeats: 1065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009430	CGGC	2	8	84	91	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009430	GC	4	8	117	124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009430	GCC	2	6	519	524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_009430	CAT	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009430	CGG	2	6	8363	8368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009430	CCGG	2	8	8445	8452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009430	G	6	6	8457	8462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009430	CGGG	2	8	8479	8486	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009430	CCT	2	6	8493	8498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009430	GCG	2	6	8509	8514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009430	CG	3	6	8513	8518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009430	GCC	2	6	8554	8559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_009430	TCC	2	6	8974	8979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009430	CGG	2	6	9056	9061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009430	CGG	2	6	9082	9087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009430	TCC	2	6	9528	9533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_009430	ACGGGC	2	12	9538	9549	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009430	CGG	2	6	9553	9558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009430	GCG	2	6	9560	9565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009430	CTC	2	6	9591	9596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009430	GC	4	8	9609	9616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009430	CCG	2	6	9619	9624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_009430	CTC	2	6	9645	9650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_009430	GCC	2	6	9693	9698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_009430	GTCCC	2	10	10325	10334	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_009430	TCC	2	6	10335	10340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_009430	CTGT	2	8	10380	10387	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_009430	CCCG	2	8	11299	11306	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_009430	TCCGC	2	10	11341	11350	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_009430	CGG	2	6	11366	11371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009430	CGC	2	6	11396	11401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009430	CCG	3	9	11402	11410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_009430	GCC	2	6	11450	11455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_009430	GCC	2	6	11462	11467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009430	C	6	6	11494	11499	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_009430	GAT	2	6	11523	11528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009430	GAG	2	6	11532	11537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009430	CCG	2	6	12540	12545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_009430	CCGG	2	8	12617	12624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009430	CTCGGG	2	12	12653	12664	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009430	CAAG	2	8	12695	12702	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009430	CGG	2	6	12709	12714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009430	GGGC	2	8	12728	12735	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009430	GAT	2	6	12749	12754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009430	CT	3	6	12755	12760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009430	GTT	2	6	12764	12769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009430	T	6	6	12796	12801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009430	C	6	6	17623	17628	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_009430	GCGCG	2	10	17640	17649	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_009430	CCG	2	6	17661	17666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_009430	CG	3	6	21178	21183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_009430	TCA	2	6	21293	21298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_009430	CGG	2	6	21460	21465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009430	GGACA	2	10	21533	21542	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_009430	CGG	2	6	21547	21552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009430	TC	3	6	21603	21608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009430	GCA	2	6	22207	22212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009430	TGCC	2	8	22222	22229	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009430	GCAG	2	8	22329	22336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009430	GAC	2	6	23161	23166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009430	ATC	2	6	23197	23202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009430	CGG	2	6	23212	23217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009430	CAA	2	6	24756	24761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009430	GAA	2	6	24774	24779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009430	GAT	2	6	24882	24887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009430	CGA	2	6	25562	25567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009430	GGC	2	6	25596	25601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009430	GCC	2	6	25612	25617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009430	CGGGG	2	10	25694	25703	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009430	CGG	2	6	27107	27112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009430	GGGGC	2	10	27176	27185	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009430	CGT	2	6	29321	29326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_009430	GCT	2	6	29331	29336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009430	TCA	2	6	29365	29370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009430	GTC	2	6	29472	29477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009430	ACT	2	6	29499	29504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009430	GCC	2	6	29523	29528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_009430	CT	3	6	32192	32197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009430	ATCG	2	8	32228	32235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009430	GCA	2	6	36642	36647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009430	GGC	2	6	36681	36686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009430	CGG	2	6	36740	36745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_009430	CAG	2	6	36769	36774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009430	CCCG	2	8	36791	36798	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_009430	GTC	2	6	36818	36823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009430	AGA	2	6	36835	36840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009430	AGC	2	6	36864	36869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_009430	CCG	2	6	36904	36909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009430	GAA	2	6	36968	36973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009430	GC	3	6	36993	36998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009430	GGC	2	6	37022	37027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009430	CG	4	8	37070	37077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009430	CG	3	6	37290	37295	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009430	CGGC	2	8	37300	37307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009430	CTT	2	6	37378	37383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009430	GC	3	6	37452	37457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009430	GCC	2	6	37504	37509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_009430	GCC	2	6	37521	37526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_009430	GCG	2	6	37571	37576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009430	TGA	2	6	37602	37607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009430	CGG	2	6	37665	37670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_009430	TGC	2	6	37685	37690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009430	AGG	2	6	37751	37756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009430	GCATC	2	10	37761	37770	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_009430	TCC	2	6	39036	39041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_009430	CCTC	2	8	39045	39052	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_009430	GAG	2	6	39127	39132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009430	TGA	2	6	40225	40230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009430	A	6	6	40265	40270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009430	CGA	2	6	40285	40290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009430	CGCGG	2	10	40306	40315	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009430	TCA	2	6	40319	40324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009430	CTGA	2	8	40346	40353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_009430	TGTCC	2	10	40941	40950	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009430	CGCC	2	8	40951	40958	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_009430	CGC	2	6	41041	41046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_009430	GCG	2	6	41150	41155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009430	AAG	2	6	41271	41276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009430	AGC	2	6	41293	41298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009430	CTG	2	6	41310	41315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009430	CGGC	2	8	42637	42644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009430	GCCC	2	8	42652	42659	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
123	NC_009430	GCC	2	6	43992	43997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_009430	CGG	3	9	44062	44070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009430	CGA	2	6	44084	44089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009430	GCG	2	6	44112	44117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009430	TCG	2	6	44131	44136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009430	GC	3	6	44171	44176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009430	CCG	2	6	44188	44193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_009430	CGGG	2	8	44213	44220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_009430	CCGG	2	8	44225	44232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009430	AGG	2	6	44248	44253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009430	ATTT	2	8	44274	44281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009430	TCCCC	2	10	44287	44296	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
135	NC_009430	GCC	2	6	44333	44338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_009430	CGCT	2	8	44349	44356	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009430	TGG	2	6	44364	44369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009430	ATCC	2	8	44433	44440	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_009430	AGG	2	6	44467	44472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009430	GC	3	6	46355	46360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009430	CGGCCG	2	12	46371	46382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009430	AGG	2	6	46402	46407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009430	C	6	6	49417	49422	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
144	NC_009430	C	6	6	49426	49431	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
145	NC_009430	GAC	2	6	52017	52022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_009430	G	6	6	53819	53824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_009430	GA	3	6	53873	53878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009430	ACG	2	6	53898	53903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_009430	CGG	2	6	53911	53916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_009430	CGG	2	6	54072	54077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_009430	TGG	2	6	54465	54470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_009430	GCA	2	6	54563	54568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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174	NC_009430	CA	3	6	55229	55234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
175	NC_009430	TGC	2	6	55237	55242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_009430	AC	3	6	55559	55564	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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284	NC_009430	GC	3	6	74815	74820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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292	NC_009430	CGG	2	6	85537	85542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_009430	CGGG	2	8	158587	158594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
422	NC_009430	CGG	2	6	158995	159000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_009430	C	6	6	159080	159085	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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426	NC_009430	CGG	2	6	159724	159729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_009430	CGC	2	6	159732	159737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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429	NC_009430	GCC	2	6	159792	159797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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463	NC_009430	CGG	2	6	162753	162758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_009430	GCCGC	2	10	163444	163453	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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483	NC_009430	CGGG	2	8	164213	164220	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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488	NC_009430	GCC	2	6	165593	165598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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